Täisautomaatsed tsentrifuugid võib nende rakenduse ja konstruktsiooni alusel liigitada mitut tüüpi, sealhulgas:
Tööstuslikud tsentrifuugid: kasutatakse sellistes tööstusharudes nagu keemia-, toiduaine- ja keskkonnakaitse sellistes rakendustes nagu muda veetustamine reovee puhastamisel ja mahla selgitamisel.
Laboratoorsed tsentrifuugid: kasutatakse teadusuuringutes ja meditsiinilistes testides, näiteks vere eraldamiseks ja rakukultuuriks.
Lauatsentrifuugid: väiksema suurusega, sobivad väikestes laborites või õppetööks.
Igal tsentrifuugitüübil on erinev disainifookus. Tööstuslikud tsentrifuugid eelistavad tavaliselt läbilaskevõimet ja vastupidavust, laboratoorsed tsentrifuugid aga täpsust ja reguleeritavust.